学科设置齐全，专科实力强大。医院现有43个临床科室，14个医技科室，7个研究所，15个治疗中心，103个实验室。其中，心血管内科、血液内科、泌尿外科、麻醉科、普外科、妇产科、呼吸内科、中西医结合科、感染性疾病科、影像医学科10个学科为国家级重点学科。心血管内科、心血管外科、血液科、消化内科、内分泌科、骨科、胸外科、妇科、产科、耳鼻咽喉头颈外科、麻醉科、中医科、检验科、临床护理18个科室为国家临床重点专科。
医院技术力量雄厚，年开展新技术100余项，多项在国内和中南地区居领先地位，并创下了同类医院单日手术251台的国内纪录。、湖北省生物靶向重点实验室和湖北省分子影像实验室等科研平台的支撑下，1979年以来医院共取得343项科研成果，其中65项达国际先进水平，278项达国内领先水平，4项成果获国家科技进步二等奖，15项成果获得省部级一等奖。
医院现有2个一级学科博士点(博士后流动站)，1个一级学科硕士点，8个系和16个教研室，拥有博士生导师136名，硕士生导师368名，先后为国家培养了博士生、硕士生，八年制、七年制、五年制临床医学专业人才21526名，同时培养留学生200多名。拥有27个国家级和省级住院医生规范化培训基地，先后中标国家继续教育项目53项，为全国各地培训高级医技人员3000余人次。由协和专家担任主编的学术专著屡获国家级大奖。
秉承“仁爱济世、协诚人和”的办院思想，协和医院将始终肩负“弘扬人道，献身医学，服务人类”的崇高使命，发扬“严谨求实，精益求精”的协和精神，不断提高医疗服务质量和服务水平，将医院建成一所符合现代医学发展和人民健康需求的大型综合性医学中心。